Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ttc28Q80XJ3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ttc28Q80XJ3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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