Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1bQ7TSF1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms