Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek5Q7TSC3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek5Q7TSC3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek5Q7TSC3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek5Q7TSC3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek5Q7TSC3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek5Q7TSC3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek5Q7TSC3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek5Q7TSC3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek5Q7TSC3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek5Q7TSC3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nek5Q7TSC3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nek5Q7TSC3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nek5Q7TSC3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nek5Q7TSC3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nek5Q7TSC3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms