Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp397Q7TNK4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms