Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc82Q6PG04 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc82Q6PG04 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms