Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ScapQ6GQT6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms