Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp2a3Q64518 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2a3Q64518 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms