Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ift52Q62559 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ift52Q62559 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ift52Q62559 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ift52Q62559 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ift52Q62559 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ift52Q62559 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ift52Q62559 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ift52Q62559 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ift52Q62559 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ift52Q62559 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ift52Q62559 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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