Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp4Q61107 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp4Q61107 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp4Q61107 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp4Q61107 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp4Q61107 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp4Q61107 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp4Q61107 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp4Q61107 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp4Q61107 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp4Q61107 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp4Q61107 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp4Q61107 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp4Q61107 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp4Q61107 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp4Q61107 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp4Q61107 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp4Q61107 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp4Q61107 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp4Q61107 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp4Q61107 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp4Q61107 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms