Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ctf1Q60753 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctf1Q60753 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ctf1Q60753 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ctf1Q60753 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ctf1Q60753 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ctf1Q60753 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ctf1Q60753 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ctf1Q60753 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ctf1Q60753 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ctf1Q60753 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctf1Q60753 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms