Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85aQ5SP85 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms