Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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