Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Mdc1Q5PSV9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mdc1Q5PSV9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mdc1Q5PSV9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mdc1Q5PSV9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mdc1Q5PSV9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms