Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spata48Q5NC83 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms