Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BB287469Q3UT53 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms