Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms