Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc4Q3UP24 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms