Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms