Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms