Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf149Q3U2C5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf149Q3U2C5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rnf149Q3U2C5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rnf149Q3U2C5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rnf149Q3U2C5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rnf149Q3U2C5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rnf149Q3U2C5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf149Q3U2C5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf149Q3U2C5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf149Q3U2C5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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