Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SctQ08535 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SctQ08535 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SctQ08535 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SctQ08535 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SctQ08535 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SctQ08535 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SctQ08535 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SctQ08535 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SctQ08535 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SctQ08535 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SctQ08535 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SctQ08535 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SctQ08535 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SctQ08535 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SctQ08535 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SctQ08535 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SctQ08535 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SctQ08535 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SctQ08535 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SctQ08535 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SctQ08535 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SctQ08535 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SctQ08535 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SctQ08535 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SctQ08535 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SctQ08535 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SctQ08535 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SctQ08535 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SctQ08535 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SctQ08535 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SctQ08535 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SctQ08535 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SctQ08535 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SctQ08535 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SctQ08535 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SctQ08535 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SctQ08535 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SctQ08535 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SctQ08535 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SctQ08535 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SctQ08535 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SctQ08535 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SctQ08535 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SctQ08535 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SctQ08535 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SctQ08535 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SctQ08535 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SctQ08535 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms