Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms