Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms