Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rcn1Q05186 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms