Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms