Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smarcad1Q04692 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms