Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms