Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms