Protein–RNA interactions for Protein: P97858

Slc35b1, Solute carrier family 35 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35b1P97858 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc35b1P97858 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms