Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx1P81068 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx1P81068 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx1P81068 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx1P81068 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx1P81068 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx1P81068 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx1P81068 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx1P81068 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx1P81068 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx1P81068 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms