Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhobP62746 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhobP62746 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhobP62746 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhobP62746 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhobP62746 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhobP62746 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhobP62746 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhobP62746 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhobP62746 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhobP62746 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhobP62746 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RhobP62746 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RhobP62746 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RhobP62746 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhobP62746 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhobP62746 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhobP62746 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhobP62746 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhobP62746 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhobP62746 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhobP62746 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhobP62746 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhobP62746 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhobP62746 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhobP62746 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhobP62746 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhobP62746 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhobP62746 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhobP62746 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhobP62746 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms