Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms