Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms