Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp5P56399 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp5P56399 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp5P56399 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp5P56399 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp5P56399 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp5P56399 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp5P56399 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms