Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DbtP53395 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DbtP53395 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DbtP53395 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DbtP53395 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DbtP53395 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DbtP53395 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DbtP53395 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DbtP53395 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DbtP53395 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DbtP53395 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DbtP53395 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DbtP53395 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DbtP53395 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DbtP53395 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DbtP53395 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DbtP53395 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DbtP53395 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DbtP53395 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DbtP53395 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DbtP53395 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DbtP53395 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbtP53395 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbtP53395 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbtP53395 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbtP53395 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbtP53395 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbtP53395 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbtP53395 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbtP53395 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbtP53395 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbtP53395 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbtP53395 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbtP53395 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbtP53395 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbtP53395 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbtP53395 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbtP53395 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbtP53395 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbtP53395 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbtP53395 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DbtP53395 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DbtP53395 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbtP53395 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbtP53395 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbtP53395 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbtP53395 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbtP53395 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbtP53395 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbtP53395 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbtP53395 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DbtP53395 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbtP53395 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbtP53395 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DbtP53395 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbtP53395 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbtP53395 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbtP53395 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbtP53395 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbtP53395 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbtP53395 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DbtP53395 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbtP53395 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbtP53395 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbtP53395 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbtP53395 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbtP53395 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbtP53395 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbtP53395 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbtP53395 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbtP53395 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbtP53395 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbtP53395 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbtP53395 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms