Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK4P51957 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK4P51957 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK4P51957 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK4P51957 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK4P51957 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK4P51957 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK4P51957 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK4P51957 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK4P51957 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK4P51957 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK4P51957 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK4P51957 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK4P51957 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK4P51957 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK4P51957 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK4P51957 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK4P51957 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK4P51957 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK4P51957 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK4P51957 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK4P51957 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK4P51957 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK4P51957 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK4P51957 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK4P51957 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK4P51957 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK4P51957 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK4P51957 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK4P51957 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK4P51957 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK4P51957 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK4P51957 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK4P51957 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK4P51957 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK4P51957 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK4P51957 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEK4P51957 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
NEK4P51957 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK4P51957 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK4P51957 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK4P51957 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK4P51957 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms