Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PtpreP49446 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpreP49446 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpreP49446 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
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PtpreP49446 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpreP49446 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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PtpreP49446 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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PtpreP49446 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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PtpreP49446 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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PtpreP49446 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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PtpreP49446 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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PtpreP49446 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpreP49446 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpreP49446 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpreP49446 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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PtpreP49446 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpreP49446 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpreP49446 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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PtpreP49446 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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PtpreP49446 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpreP49446 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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PtpreP49446 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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PtpreP49446 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpreP49446 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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