Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms