Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox2P48432 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox2P48432 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox2P48432 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox2P48432 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox2P48432 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox2P48432 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox2P48432 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox2P48432 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox2P48432 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms