Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms