Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab20P35295 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab20P35295 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab20P35295 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms