Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms