Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms