Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl13aP19253 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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