Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lama1P19137 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lama1P19137 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lama1P19137 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lama1P19137 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lama1P19137 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms