Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms