Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18529 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18529 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18529 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18529 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18529 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18529 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18529 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18529 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18529 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18529 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18529 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18529 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18529 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18529 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18529 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18529 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18529 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18529 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18529 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18529 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18529 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18529 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18529 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18529 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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