Protein–RNA interactions for Protein: P15388

Kcnc1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc1P15388 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnc1P15388 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms