Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms