Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lire1P11260 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms